Tag Archives for 生物信息学

一种快速简单的性状定位的方法BSA简介

BSA(Bulk segregant analysis)称为混合分组分析法,是近年来兴起的一种快速简单的性状定位的方法。广泛运用于拟南芥、水稻、玉米、黄瓜等物种上。BSA最大的特点之一就是将两种极端性状的子代个体混合测序(pool-seq)。但BSA绝对不是混池测序这么简单,实际上根据群体材料、实验设计的不同,BSA又有各种不同的方法。接下来就为大家一一介绍。

26. 一月 2018 by admin
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03. 四月 2015 by admin
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破解小麦基因组难题

小麦是我们人类重要的粮食来源,不过小麦基因组(wheat genome)却是一个非常复杂,而且规模庞大的基因组,所以科学家们一直都没能完成小麦基因组的测序工作。但是对这种植物的基因进行全面的分析会有助于我们提高小麦的粮食产量。用于生产面包的小麦的基因组一直都是困扰科研人员的一大难题。因为小麦基因组的规模大约是我们人类基因组的6倍,共计有17Gb(gigabase),而且小麦基因组是六倍体(hexaploid),也就是说一共有6套染色体,即小麦基因组是由3套不同的基因组组成的。

26. 十二月 2012 by admin
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UniGene数据库百科

UniGene是一种生物信息学数据库。UniGene通过计算机程序对GeneBank 中的序列数据进行适当处理,剔除冗余部分,将同一基因的序列,包括EST序列片段搜集到一起,以便研究基因的转录图谱。UniGene除了包括人的基因外,也包括小鼠、大鼠等其它模式生物的基因,而HGI数据库只包括人的基因。该数据库的标题行(TITLE)给出基因的名称和简单说明,表达部位行(EXPRESS)指出该基因在什么组织中表达以及在基因图谱中的位置等。此外,列出该基因在核酸序列数据库GenBank或EMBL和蛋白质序列数据库SWISS-PROT中的编号的超文本链接。UniGene中部分条目包括已知基因序列,而有些条目则仅有新测得的EST序列片段。这就意味着,这些EST序列所对应的基因尚未搞清,可以用来发现新基因。在描绘基因图谱及大规模基因表达分析等研究中,UniGene也可以帮助实验设计者选择试剂。UniGene可以通过NCBI或SRS系统访问。

30. 十月 2012 by admin
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生物信息学定义

生物信息学是以生物大分子为研究,以计算机为工具,运用数学和信息科学的观点、理论和方法去研究生命现象、组织和分析呈指数级增长的生物信息数据的一门科学。生物信息学不仅仅是一门科学,它更是一种重要的研究开发工具,只有通过生物信息学的计算处理,才能从众多分散的生物学观测数据中获得对生命运行机制的详细和系统的理解。其研究热点包括:序列对比、基因识别和DNA序列分析、蛋白质结构预测、分子进化、数据库中知识发现等。通过同源性比较和比较基因组学对基因功能的研究是后基因组时代生物信息学的主要任务之一。同源性比较是指将一段结构和功能未知的新DNA片段与数据库中结构或功能已知的序列(DNA 或蛋白质))进行比对来推测整个基因或其中某一区段功能的过程。比较基因组学是基于基因组图谱和测序基础上,对已知的基因和基因组结构进行比较,来了解基因的功能、表达机理和物种进化的学科。

27. 三月 2012 by admin
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功能基因组学研究内容

基因组(Genome) 是1924 年提出用于描述生物的全部基因和染色体组成的概念。1986年由美国科学家Thomas Roderick 提出的基因组学(Genomics) 指对所有基因进行基因组作图(包括遗传图谱、物理图谱、转录本图谱),核苷酸序列分析,基因定位和基因功能分析的一门科学。因此,基因组研究应该包括两方面的内容:以全基因组测序为目标的结构基因组学和以基因功能鉴定为目标的功能基因组学。目前,基因组学研究已经由以全基因组测序为目标的结构基因组学转向以基因功能鉴定为目标的功能基因组学研究。

27. 三月 2012 by admin
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